Las actividades secundarias en Luján están vinculadas principalmente con el sector industrial, el cual representa un 20% del PBG local y el 16% de las MiPyMEs radicadas en el Partido.

Estas actividades se distribuyen principalmente entre construcción e industria. Esta última se focaliza en tres cadenas de valor:

• Alimentos: que toma la producción agropecuaria para su industrialización en todos sus aspectos, desde la agroindustria a la producción de alimentos de consumo masivo y de insumos alimenticios para esta.
• Textil: históricamente desarrollado en la localidades de Jáuregui y Pueblo Nuevo, este sector se caracteriza por algunas industrias de grandes volúmenes y un centenar de pequeños talleres familiares, principalmente enfocados en la producción de tejido plano.
• Metalúrgico - Metalmecánico: resultante de un histórico desarrollo de máquinas-herramientas, en la actualidad se focaliza en varias empresas autopartistas acompañadas de un archipielago de pequeñas metalúrgicas que les suministran piezas; y talleres proveedores de herramientas, piezas y partes a los otros sectores.

Las conocidas como "industrias naranjas", vinculadas a la producción de soluciones informáticas y producción audiovisual, se encuentran en franco crecimiento pero aún sin un peso representativo dentro del PBG..